Inhalt: The Alchemist of the Mysterious Dream folgt weiter den Abenteuern von Sophie und Plachta. Nachdem sie Sophies Heimatstadt Kirchen-Bell verlassen, entdecken die beiden einen riesigen Baum, der Plachta zuvor bereits in einem Traum erschienen ist. Als sie sich ihm nähern, werden sie in einen mysteriösen Wirbel gezogen. Sophie erwacht alleine in einer neuen seltsamen Welt der Erde-Wiege und es dauert nicht lange, bis Sophie von einer Alchemistin namens Plachta erfährt, die am Rande der Stadt lebt. Zu ihrem Erstaunen handelt es sich allerdings nicht um ihre Freundin, sondern um ein Mädchen, das nur denselben Namen trägt. Welche weiteren Überraschungen erwarten Sophie auf dieser Reise? Im Laufe des Abenteuers lernt sie den aufstrebenden Alchemisten Ramizel Erlenmeyer kennen, der sich bereiterklärt, ihr in ihrer Not zu helfen. Die Geschichte entfaltet sich elegant mit einem charmanten neuen visuellen Stil, der die Kunst der Mysterious-Subserie mit den hochwertigen Grafiken und Animationen aus Atelier Ryza 2: Lost Legends and the Secret Fairy verbindet.